Reading flag data from Agilent files
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@florian-chain-1708
Last seen 11.4 years ago
Bonjour, je r?ponds, tres tardivement ? la question pos?e sur la liste Bioconductor. De notre c?t?, nous avons utilis? ces deux lignes de commandes: wtAgilent.mRGFilter <- function(qta) { mapply(min,qta[,"gIsPosAndSignif"],qta[,"rIsPosAndSignif"]) } RG<-read.maimages(targets, source="agilent", wt.fun=wtAgilent.mRGFilter) ces commandes sont le fruit de d?ductions faites en parcourant longuement les fils de discussion et donnent un mod?le g?n?ral permettant d'utiliser les flags d'Agilent. Il suffit a priori de remplacer gIsPosAndSignif ou rIsPosAndSignif par le ou les flags souhait?s. Bon courage Florian Chain
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